Kaj morate vedeti
- Datoteka FNA je datoteka za poravnavo zaporedij DNK in proteinov v formatu FASTA.
- Odprite eno z Geneious.
- Pretvori v FASTA in podobne formate z istim programom.
Ta članek pojasnjuje, kaj je datoteka FNA, kako jo odpreti in kako jo shraniti v drugo obliko, kot je FASTA, GB, VCF, slike itd.
Kaj je datoteka FNA?
Datoteka z datotečno pripono FNA je datoteka za poravnavo DNK in proteinskih zaporedij v formatu FASTA, ki shranjuje informacije o DNK, ki jih lahko uporablja programska oprema za molekularno biologijo.
Datoteke FNA se lahko uporabljajo samo za shranjevanje informacij o nukleinskih kislinah, medtem ko drugi formati FASTA vsebujejo druge informacije, povezane z DNK, na primer tiste s FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ Datotečne pripone, NET ali AA.
Ti besedilni formati FASTA so prvotno nastali iz programskega paketa z enakim imenom, zdaj pa se uporabljajo kot standard v aplikacijah za poravnavo zaporedij DNK in beljakovin.
FNA se nanaša tudi na nekatere tehnološke izraze, ki nimajo nobene zveze s to obliko zapisa datoteke, kot so končna sprejemljivost omrežja, možnost razširitve imena datoteke/atributov, omrežna arhitektura Fujitsu in hitro sosednje oglaševanje.
Kako odpreti datoteko FNA
Odprite eno v sistemih Windows, macOS in Linux z Geneious (brezplačno je 14 dni). Če želite to narediti, se pomaknite do menija Datoteka > Uvoz in izberite uvoz datoteke prek Iz datotekeelement menija.
Morda ga lahko odprete tudi z BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Poskusite Notepad++ ali drug urejevalnik besedila, če te ideje ne delujejo. Datoteka je morda res besedilna in enostavna za branje ali pa ugotovite, da nima nobene zveze s formatom FASTA; v tem primeru lahko odpiranje datoteke kot besedilnega dokumenta razkrije besedilo, ki identificira, kaj je bilo uporabljeno za ustvarjanje datoteke ali v kateri obliki je datoteka.
Kako pretvoriti datoteko FNA
Tega ne moremo preveriti, ker tega še nismo poskusili, vendar bi morali imeti možnost uporabiti Geneious za pretvorbo datoteke v veliko drugih formatov, kot so FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV in VCF. To lahko storite prek menija programa Datoteka > Izvozi.
Ta isti program bi moral imeti tudi možnost shraniti datoteko v PNG, JPG, EPS ali PDF prek Datoteka > Shrani kot slikovno datoteko.
Čeprav običajno ne morete preprosto preimenovati pripone datoteke v nekaj drugega in pričakovati, da bo delovala na enak način, lahko datoteko. FNA preimenujete v datoteko. FA, če bo vaša programska oprema za določanje zaporedja DNK prepoznala samo format FA.
Namesto preimenovanja datotečnih končnic boste želeli uporabiti brezplačen pretvornik datotek za pretvorbo drugih vrst datotek. V primeru datotek FNA in FA se zgodi, da bodo nekateri programi odprli samo datoteke s pripono datoteke FA, v tem primeru bi moralo preimenovanje delovati dobro.
Še vedno ne morete odpreti?
Če po uporabi zgornjih programov še vedno ne morete odpreti svoje datoteke, boste morda ugotovili, da končnica datoteke dejansko ne bere. FNA, temveč nekaj, kar je samo videti podobno.
Datoteke FNG (Font Navigator Group) so na primer videti tako, kot da piše ". FNA", a če pogledate natančno, sta le prvi dve črki enaki. Ker so datotečne pripone različne, je to znak, da imajo drugačno obliko zapisa datoteke in najverjetneje ne bodo delovale z istimi programi.
Enako bi lahko rekli za mnoge druge datotečne pripone, kot so FAX, FAS (prevedeni AutoLISP za hitro nalaganje), FAT, FNTA (pisava Aleph One), FNC (funkcije Vue) in FND (shranjeno iskanje v sistemu Windows).
Zamisel je, da se prepričate, da se končnica datoteke glasi. FNA. Če se, poskusite znova uporabiti programe od zgoraj, da ga odprete ali pretvorite. Če imate drugo vrsto datoteke, raziščite njeno razširitev, da ugotovite, katere aplikacije so potrebne za odpiranje ali pretvorbo.
FAQ
Kako odprete datoteko FNA v Pythonu?
Najprej pretvorite datoteko FNA v format FASTA z uporabo aplikacije tretje osebe, kot je Geneious. Nato lahko prenesete Biopython, niz prosto dostopnih orodij za biološko računanje za delo v bioinformatiki. Nazadnje si oglejte Biopython Tutorial and Cookbook za navodila o delu z datotekami FASTA.
Kako najdem svoje številke izdelovalca FNA v neobdelani datoteki Ancestry?
Večino DNK podatkov lahko prenesete s spletnega mesta Ancestry.com v formatu.txt. Vendar pa imajo samo stranke, katerih DNK je bil analiziran s sekvenciranjem naslednje generacije (NGS), možnost prenosa datoteke VCF. Če želite prenesti datoteko VCF, morate biti lastnik DNK, opraviti testiranje DNK s tehnologijo NGS in imeti na svoji napravi vsaj 350 MB prostora.
